Главным богатством курорта является лечебное озеро Карачи, которое представляет собой эллипсообразный материковый, бессточный горько-соленый водоем площадью 362 гектара. Его глубина зависит от атмосферных осадков, температуры воздуха и количества воды в близлежащих озерах Узункуль, Малый и Большой Яркуль, которые находятся в гидрологической взаимосвязи с озером Карачи. Озеро заполнено рапой, которая содержит различные соли в количестве от 50 до 250 граммов на литр, на дне озера ровным слоем залегает лечебная грязь.
В результате длительной эволюции сформировался своеобразный биогеоценоз, в озере обитают разнообразные микроорганизмы, бактерии и совокупность растительных организмов. Фитопланктон служит пищей для основного обитателя озера — членистоногого рачка Artemiae Salinae, после гибели рачок становится добычей сульфатредуцирующих бактерий, которые образуют продукты, входящие в состав лечебной грязи и служащие питательным материалом для водорослей. Продуктами жизнедеятельности этого биоценоза являются лечебная грязь и рапа.